Где лежат логи: Location of ESXi 3.5-4.1 log files
Другое дело, что если ESXi установлен на раздел меньше 4 GB, всю временную информацию он хранить на ram-диске, т.ч. логи легко могут быть потеряны или перезаписаны. Проверьте, создана ли у вас Scratch Partition.
Подробнее: http://www.vmgu.ru/news/vmware-esxi-scratch-partition
Как создать: Creating a persistent scratch location for ESXi 4.x and 5.x