Разнесите трафик по разным vlan и разным физическим линкам, тогда влияние гарантированно никакого не будет.
Понять как ходит трафик можно проанализировав какой алгоритм балансировки используется для iSCSI и сколько путей до СХД используется.
Белая бумажка от Vmware: http://www.vmware.com/files/pdf/techpaper/vmware-multipathing-configuration-software-iSCSI-port-binding.pdfи статья
Это должно помочь 