こんにちは。
スナップショットはバックアップではないので、スナップショットからは壊れてしまった仮想マシンを復旧することはできません。
VMDKファイルは、障害の前に開けてましたか?(バイナリなので、ファイルをオープンして何かをするというようなファイルでは無いので気になりました。)
VMDKファイルが壊れていないようであれば、新しく仮想マシンをつくって、HDDに壊れてしまった仮想マシンのVMDKファイルを当てることで動く可能性もあります。
ただ、状況が状況なのでコミュニティでご質問されるよりは、サポート窓口にお問い合わせいただくのが一番だと思います。