1. Удалить виртуальный диск из виртуальной машины.
(Edit settings -- Hard disk -- Remove -- Remove from virtual machine)
2. Переименовать файл через Browse datastore -- Rename
2bis (для героев командной строки) зайти на хост по ssh, переименовать
оба файла диска (VM.vmdk и VM-flat.vmdk)
затем отредактировать VM.vmdk исправив внутри имя диска на VM-flat.vmdk
3. Добавить диск обратно как "Use existing"
Edit setting -- Add - - Add Hard disk -- Use existing -- Browse...